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- Trachelomonas manginii var. manginiin. 马恩吉囊裸藻原变种
- Trachelomonas manginii var. punctatan. 马恩吉囊裸藻点纹变种
- Trachelomonas manginii var. annulatan. 马恩吉囊裸藻环纹变种
- Trachelomonas manginiin. 马恩吉囊裸藻
- Trachelomonas intermedia var. papilliferan. 中型囊裸藻乳突变种
- Trachelomonas intermedia var. spiniferan. 中型囊裸藻具刺变种
- Trachelomonas intermedia var. intermedian. 中型囊裸藻原变种
- Trachelomonas intermedia var. laevisn. 中型囊裸藻平滑变种
- Trachelomonas intermedia var. spinulosan. 中型囊裸藻微刺变种
- Trachelomonas hexangulata var. majorn. 六角囊裸藻大型变种
- Trachelomonas bacillifera var. bacilliferan. 具棒囊裸藻原变种
- Trachelomonas bacillifera var. miniman. 具棒囊裸藻微小变种
- Trachelomonas superba var. papillatan. 华丽囊裸藻乳突变种
- Trachelomonas superba var. duplexn. 华丽囊裸藻端刺变种
- Trachelomonas australica var. australican. 南方囊裸藻原变种
- Trachelomonas australica var. granulatan. 南方囊裸藻颗粒变种
- Trachelomonas oviformis var. globosan. 卵形囊裸藻球形变种
- Trachelomonas crassitheca var. subglobosan. 厚壁囊裸藻近球变种
- Trachelomonas amphora var. laevisn. 双耳瓶囊裸藻平滑变种
- Trachelomonas dubia var. crassiannulatan. 可疑囊裸藻厚环变种