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- Microcoleus chthonoplastesn. 原型微鞘藻
- Microcoleus sinensis var. simpliciusculusn. 中华微鞘藻简单变种
- Microcoleus sinensisn. 中华微鞘藻
- Microcoleus vaginatusn. 具鞘微鞘藻
- Microcoleus confluensn. 合生微鞘藻
- Microcoleus paludosusn. 沼池微鞘藻
- Microcoleus tenerrimusn. 细柔微鞘藻
- Microcoleus sociatusn. 集合微鞘藻
- Microcoleus majusculan. 巨型微鞘藻
- Microcoleusn. 微鞘藻属(颤藻科)
- Microcoleus lacustrisn. 湖泊微鞘藻
- Microcoleus subtorulosusn. 纽曲微鞘藻